In 1918 werd de opdracht gegeven voor de bouw van het derde hoofdadministratiekantoor in Utrecht, waar men verwachte dat het knooppunt van de spoorwegen in Nederland zou komen te liggen. De bouw van de Inktpot nam drie jaar in beslag. Om voldoende materialen voor de bouw te krijgen kocht de NS twee steenfabrieken en een timmerbedrijf. Voor de begeleiding van de bouw werd een nieuw bedrijf opgericht; het latere Strukton. Voor de fundering gebruikte men 21 kilometer aan stoorstaven en voor de inrichting 4.000m3 eikenhout.

Tijdens de renovatie is de gevel is gereinigd en gerepareerd en hebben 22 miljoen bakstenen hebben nu hun oorspronkelijke kleur bruin met rode en gele accenten weer terug gekregen. Beglazing is vervangen in dubbelglas waarop een profiel is gelijmd om de ramen een klassieke uitstraling te geven. Verder is ook de binnenkant van het gebouw onderhanden genomen en sterk gemoderniseerd.

De Inktpot is momenteel eigendom van NS Vastgoed en huisvest onderdelen van ProRail.